Según la leyenda el cuerpo descuartizado del Obispo Estanislao, tirado al estanque, se reensambló milagrosamente. Por ello durante el periodo de las particiones de Polonia San Estanislao se convirtió en el símbolo de la unidad de las tierras. Una de las criptas debajo de la iglesia se conoce como la Cripta de los Grandes Polacos, o el Panteón Nacional. Aquí se encuentran los sepulcros de Jan Długosz, Wincenty Pol, Stanislaw Wyspiański, Jacek Malczewski, Karol Szymanowski y Czeslaw Miłosz, entre otros.

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