La primera pequeña iglesia gótica de madera fue fundada en este lugar ya en el siglo XIV junto con el hospital de la ciudad; de modo que era ésta una capilla de hospital. En el siglo XVII los servicios espirituales del hospital pasaron a estar a cargo de los monjes Paulinos, que habían sido traídos a Polonia y que fundaron un monasterio junto al hospital. El imponente bloque barroco que se encuentra actualmente en el lugar, recuerda al que fue levantado por los Paulinos a principios del siglo XVIII. Los diseñadores de la enorme iglesia barroca fueron los arquitectos Józef Piola y Józef Szymon Bellotti.
La iglesia fue destruida durante el Alzamiento de Varsovia, en el año 1944. En el año 1956 se reconstruyó el monasterio, el frontón barroco con figuras de los santos, el púlpito barroco y el altar mayor.
Junto a la iglesia se halla el edificio más pequeño de Varsovia, en el cual funciona un estanco.
Desde hace cerca de 300 años, a principios de agosto, desde el frente de la iglesia parte la mayor peregrinación a pie hacia Jasna Góra, en Częstochowa (el santuario marianista más importante de Polonia y a su vez el monasterio más conocido de los PP. Paulinos).

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